AGNES聚类原理及流程,并用python给出一段此聚类的代码

时间: 2023-08-01 19:15:28 浏览: 56
AGNES聚类是一种层次聚类算法,其原理是将样本逐步合并成越来越大的簇,形成一个层次结构。AGNES的全称是Agglomerative Nesting,即自底向上凝聚的层次聚类法。 AGNES的流程如下: 1. 初始化:把每个样本看成一个簇; 2. 计算样本之间的距离(相似度); 3. 合并距离最近的两个簇为一个簇; 4. 重新计算样本之间的距离; 5. 重复步骤3和4,直到所有样本都被合并成为一个簇。 以下是用Python实现AGNES聚类的代码: ```python from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering import numpy as np # 构造样本数据 X = np.random.rand(10, 2) # 创建AGNES聚类器对象 model = AgglomerativeClustering(n_clusters=2, linkage='ward') # 训练模型并预测分类 y = model.fit_predict(X) # 打印分类结果 print(y) ``` 在上述代码中,我们使用了Scikit-learn库中的AgglomerativeClustering类来实现AGNES聚类。其中,n_clusters参数指定聚类簇的个数,linkage参数指定计算簇之间距离的方法。fit_predict方法用于训练模型并预测分类结果,最后打印出分类结果。
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diana聚类与agnes聚类 python代码

以下是使用Python实现Diana聚类和Agnes聚类的代码示例: Diana聚类: ```python from scipy.spatial.distance import pdist,squareform from scipy.cluster.hierarchy import linkage,dendrogram import numpy as np # 生成随机数据 X = np.random.random_sample([5,3])*10 # 计算距离矩阵 d = pdist(X) # 计算聚类链 linkage_matrix = linkage(d, 'single') # 画出树状图 dendrogram(linkage_matrix) ``` Agnes聚类: ```python from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering import numpy as np # 生成随机数据 X = np.random.random_sample([5,3])*10 # 进行聚类 clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=2).fit(X) # 输出聚类结果 print(clustering.labels_) ``` 需要注意的是,Diana聚类需要手动计算距离矩阵和聚类链,而Agnes聚类可以直接使用sklearn库进行实现。

diana聚类与agnes聚类 可视化python代码

以下是使用Python可视化Diana聚类和Agnes聚类的代码示例: Diana聚类可视化: ```python from scipy.spatial.distance import pdist,squareform from scipy.cluster.hierarchy import linkage,dendrogram import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt # 生成随机数据 X = np.random.random_sample([5,3])*10 # 计算距离矩阵 d = pdist(X) # 计算聚类链 linkage_matrix = linkage(d, 'single') # 画出树状图 dendrogram(linkage_matrix) # 添加标题和标签 plt.title('Diana Clustering') plt.xlabel('Samples') plt.ylabel('Distance') # 显示图形 plt.show() ``` Agnes聚类可视化: ```python from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt # 生成随机数据 X = np.random.random_sample([5,3])*10 # 进行聚类 clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=2).fit(X) # 可视化聚类结果 plt.scatter(X[:,0], X[:,1], c=clustering.labels_, cmap='rainbow') # 添加标题和标签 plt.title('Agnes Clustering') plt.xlabel('X') plt.ylabel('Y') # 显示图形 plt.show() ``` 需要注意的是,Diana聚类可视化主要是通过画出树状图来展示聚类结果,而Agnes聚类可视化则可以通过散点图来展示。

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