AGNES聚类原理及流程,并用python给出一段此聚类的代码
时间: 2023-08-01 19:15:28 浏览: 56
AGNES聚类是一种层次聚类算法,其原理是将样本逐步合并成越来越大的簇,形成一个层次结构。AGNES的全称是Agglomerative Nesting,即自底向上凝聚的层次聚类法。
AGNES的流程如下:
1. 初始化:把每个样本看成一个簇;
2. 计算样本之间的距离(相似度);
3. 合并距离最近的两个簇为一个簇;
4. 重新计算样本之间的距离;
5. 重复步骤3和4,直到所有样本都被合并成为一个簇。
以下是用Python实现AGNES聚类的代码:
```python
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
import numpy as np
# 构造样本数据
X = np.random.rand(10, 2)
# 创建AGNES聚类器对象
model = AgglomerativeClustering(n_clusters=2, linkage='ward')
# 训练模型并预测分类
y = model.fit_predict(X)
# 打印分类结果
print(y)
```
在上述代码中,我们使用了Scikit-learn库中的AgglomerativeClustering类来实现AGNES聚类。其中,n_clusters参数指定聚类簇的个数,linkage参数指定计算簇之间距离的方法。fit_predict方法用于训练模型并预测分类结果,最后打印出分类结果。
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diana聚类与agnes聚类 python代码
以下是使用Python实现Diana聚类和Agnes聚类的代码示例:
Diana聚类:
```python
from scipy.spatial.distance import pdist,squareform
from scipy.cluster.hierarchy import linkage,dendrogram
import numpy as np
# 生成随机数据
X = np.random.random_sample([5,3])*10
# 计算距离矩阵
d = pdist(X)
# 计算聚类链
linkage_matrix = linkage(d, 'single')
# 画出树状图
dendrogram(linkage_matrix)
```
Agnes聚类:
```python
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
import numpy as np
# 生成随机数据
X = np.random.random_sample([5,3])*10
# 进行聚类
clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=2).fit(X)
# 输出聚类结果
print(clustering.labels_)
```
需要注意的是,Diana聚类需要手动计算距离矩阵和聚类链,而Agnes聚类可以直接使用sklearn库进行实现。
diana聚类与agnes聚类 可视化python代码
以下是使用Python可视化Diana聚类和Agnes聚类的代码示例:
Diana聚类可视化:
```python
from scipy.spatial.distance import pdist,squareform
from scipy.cluster.hierarchy import linkage,dendrogram
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# 生成随机数据
X = np.random.random_sample([5,3])*10
# 计算距离矩阵
d = pdist(X)
# 计算聚类链
linkage_matrix = linkage(d, 'single')
# 画出树状图
dendrogram(linkage_matrix)
# 添加标题和标签
plt.title('Diana Clustering')
plt.xlabel('Samples')
plt.ylabel('Distance')
# 显示图形
plt.show()
```
Agnes聚类可视化:
```python
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# 生成随机数据
X = np.random.random_sample([5,3])*10
# 进行聚类
clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=2).fit(X)
# 可视化聚类结果
plt.scatter(X[:,0], X[:,1], c=clustering.labels_, cmap='rainbow')
# 添加标题和标签
plt.title('Agnes Clustering')
plt.xlabel('X')
plt.ylabel('Y')
# 显示图形
plt.show()
```
需要注意的是,Diana聚类可视化主要是通过画出树状图来展示聚类结果,而Agnes聚类可视化则可以通过散点图来展示。