r语言gibbs抽样
时间: 2023-07-18 20:18:32 浏览: 95
Gibbs抽样是一种基于马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)的抽样方法,通常用于高维分布的抽样。在R语言中,可以使用MCMC包中的函数gibbs()实现Gibbs抽样。
gibbs()函数需要指定以下参数:
- n:指定样本数量
- init:指定初始值
- mu:指定均值向量
- Sigma:指定协方差矩阵
下面是一个使用gibbs()函数实现Gibbs抽样的示例代码:
```R
library(MCMC)
# 定义目标分布函数
target <- function(x1, x2) {
exp(-(x1^2 + x2^2)/2) * (0.5*sin(x1) + 0.5*cos(x2))
}
# 定义条件分布函数
cond1 <- function(x2) {
rnorm(1, mean = 0.5*sin(x2), sd = 1)
}
cond2 <- function(x1) {
rnorm(1, mean = 0.5*cos(x1), sd = 1)
}
# 设置参数
n <- 1000
init <- c(0, 0)
mu <- c(0, 0)
Sigma <- matrix(c(1, 0.5, 0.5, 1), nrow = 2)
# 进行Gibbs抽样
result <- gibbs(n = n, init = init, mu = mu, Sigma = Sigma, cond = list(cond1, cond2))
# 输出结果
plot(result)
```
上述代码中,我们定义了一个二元高斯分布作为目标分布函数,使用rnorm()函数实现了两个条件分布函数cond1()和cond2(),并使用gibbs()函数进行了Gibbs抽样。最后,我们将结果绘制成图形进行展示。
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