Error in `[<-`(`*tmp*`, , cluster2, value = c(TCGA.27.1832.01 = "high", : subscript out of bounds
时间: 2023-06-10 11:06:46 浏览: 193
这个错误通常表示您正在尝试在矩阵或数据框中使用超出范围的索引。请检查您的代码,确保您正在使用正确的索引。可能需要检查以下几个方面:
1. 索引是否超出了矩阵或数据框的维度范围?
2. 您是否使用了负数索引或非整数索引?
3. 您是否使用了不同长度的向量进行索引?
您可以先使用print()函数输出相关变量,以便更好地理解和调试问题。
相关问题
错误于`[[<-.data.frame`(`*tmp*`, g, value = list(`TCGA-3L-AA1B` = 5.129171719, : 替换数据里有1行,但数据有431
这个错误消息是在R语言中发生的,它涉及到对"data.frame"数据结构的修改操作。`[[<-.data.frame`是一个用于向数据框(data frame)添加、替换或修改元素的函数,但是在这个例子中出现了问题:
1. `*tmp*`可能是一个临时变量名,代表了一个现有的data frame对象。
2. `g`可能是列名或者是索引位置,试图将值插入到data frame中对应的位置。
3. 调用`value = list(...)`表示你想要插入一个新的列表,其中包含了键值对,如`"TCGA-3L-AA1B"`对应`5.129171719`。
4. 问题在于你尝试替换的数据只有1行,然而data frame `*tmp*`的实际大小有431行。这意味着你指定的键(例如`"TCGA-3L-AA1B"`)对应的值应该只存在于最后一行,而你现在试图把它放到其他位置。
解决此问题的方法通常是要检查列名是否正确,以及确认你想要插入新值的位置是否正确。如果确实只需要插入一行,你需要确保`g`指向的是正确的行号,而不是列名。如果`g`是列名,可能需要先检查该列是否存在,或者是否已满,然后再进行插入。
> query <- TCGAquery(project = "TCGA-OV", + data.category = "Transcriptome Profiling", + data.type = "Gene Expression Quantification", + platform = "Illumina HiSeq", + file.type = "normalized_results") Error in TCGAquery(project = "TCGA-OV", data.category = "Transcriptome Profiling", : could not find function "TCGAquery"怎么回事
这个错误信息显示R无法找到名为"TCGAquery"的函数,这可能是因为您没有正确加载TCGAbiolinks包。
请在R控制台中输入以下命令,安装并加载TCGAbiolinks包:
```
install.packages("TCGAbiolinks")
library(TCGAbiolinks)
```
然后再次尝试运行您的代码,看看是否还会出现相同的错误。如果还是出现相同的错误,请尝试重新启动R,然后再次加载TCGAbiolinks包,再运行您的代码。
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