Error in `[<-`(`*tmp*`, , cluster2, value = c(TCGA.27.1832.01 = "high", : subscript out of bounds
时间: 2023-06-10 18:06:46 浏览: 59
这个错误通常表示您正在尝试在矩阵或数据框中使用超出范围的索引。请检查您的代码,确保您正在使用正确的索引。可能需要检查以下几个方面:
1. 索引是否超出了矩阵或数据框的维度范围?
2. 您是否使用了负数索引或非整数索引?
3. 您是否使用了不同长度的向量进行索引?
您可以先使用print()函数输出相关变量,以便更好地理解和调试问题。
相关问题
> query <- TCGAquery(project = "TCGA-OV", + data.category = "Transcriptome Profiling", + data.type = "Gene Expression Quantification", + platform = "Illumina HiSeq", + file.type = "normalized_results") Error in TCGAquery(project = "TCGA-OV", data.category = "Transcriptome Profiling", : could not find function "TCGAquery"怎么回事
这个错误信息显示R无法找到名为"TCGAquery"的函数,这可能是因为您没有正确加载TCGAbiolinks包。
请在R控制台中输入以下命令,安装并加载TCGAbiolinks包:
```
install.packages("TCGAbiolinks")
library(TCGAbiolinks)
```
然后再次尝试运行您的代码,看看是否还会出现相同的错误。如果还是出现相同的错误,请尝试重新启动R,然后再次加载TCGAbiolinks包,再运行您的代码。
Error: unexpected symbol in "metadata_pair <- metadata_pair[metadata_pair$TCGA_id !=TCGA-44-3917-01B"
这个错误通常是因为在代码中使用了无效的符号。在这种情况下,是因为“-”符号没有被正确地引用。请尝试将“-”符号改为下划线“_”或使用引号将其括起来,例如:
```
metadata_pair <- metadata_pair[metadata_pair$TCGA_id != "TCGA-44-3917-01B"]
```
或者
```
metadata_pair <- metadata_pair[metadata_pair$TCGA_id != TCGA_44_3917_01B]
```