用python实现LLE降维
时间: 2023-09-23 14:13:28 浏览: 83
dimensionality_reduction_alo,PCA、LDA、MDS、LLE、TSNE等降维算法的python实现
LLE(Locally Linear Embedding)是一种非线性降维算法,可以保留数据的局部结构。其基本思想是将高维数据映射到低维空间上,并保持数据之间的距离关系不变。以下是用Python实现LLE降维的代码:
```python
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import cdist
def lle(X, n_neighbors, n_components):
# 计算输入数据的样本点数和维度
n_samples, n_features = X.shape
# 计算样本点之间的欧几里得距离
dist = cdist(X, X, 'euclidean')
# 对每个样本点,找到其最近的n_neighbors个样本点
neighbors = np.argsort(dist, axis=1)[:, 1:n_neighbors+1]
# 初始化重建权重矩阵
W = np.zeros((n_samples, n_neighbors))
# 对每个样本点,计算其在最近的n_neighbors个样本点上的线性重建权重
for i in range(n_samples):
Xi = X[neighbors[i]]
Xi -= Xi.mean(axis=0)
C = np.dot(Xi, Xi.T)
w = np.linalg.solve(C, np.ones(n_neighbors))
w /= w.sum()
W[i] = w
# 计算降维后的低维表示
M = np.eye(n_samples) - W.T.dot(W)
eigvals, eigvecs = np.linalg.eig(M)
indices = eigvals.argsort()[:n_components]
return eigvecs[:, indices].real
```
其中,输入参数`X`是一个`n_samples`行`n_features`列的矩阵,表示样本数据。`n_neighbors`是一个整数,表示每个样本点选择的最近邻数。`n_components`是一个整数,表示降维后的维度。
函数首先计算输入数据样本点之间的欧几里得距离,并找到每个样本点的最近邻。然后,对于每个样本点,计算其在最近的n_neighbors个样本点上的线性重建权重。最后,使用重建权重矩阵计算降维后的低维表示,并返回降维后的结果。
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