题目一 现有1500个二维空间的数据点,请完成如下工作: (1).编写一个程序不调用sklearn.manifold ,实现ISOMAP降维度。 (2).编写一个程序不调用locally_linear_embedding,实现LLE降维。
时间: 2024-01-21 12:20:02 浏览: 94
ISOMAP算法的实现:
ISOMAP算法是一种基于流形学习的非线性降维方法,主要用于处理高维数据。其基本思想是在保持数据间的距离不变的情况下,将高维数据映射到低维空间中。
ISOMAP算法的主要步骤如下:
1.计算每个数据点之间的欧几里得距离。
2.对于每个数据点,找到与其距离最近的K个数据点,并建立它们之间的边。
3.使用Floyd算法计算任意两个数据点之间的最短路径。
4.基于最短路径计算数据点之间的测地距离。
5.将测地距离作为输入,使用MDS算法将数据点映射到低维空间中。
下面是ISOMAP算法的Python实现:
```python
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import cdist
from scipy.sparse import lil_matrix, csgraph
from sklearn.utils.graph_shortest_path import graph_shortest_path
def isomap(X, n_components, n_neighbors):
# 计算每个数据点之间的欧几里得距离
D = cdist(X, X)
# 对于每个数据点,找到与其距离最近的K个数据点,并建立它们之间的边
knn_graph = lil_matrix((X.shape[0], X.shape[0]), dtype=np.float32)
for i in range(X.shape[0]):
indices = np.argsort(D[i])[1:n_neighbors+1]
knn_graph[i, indices] = D[i, indices]
# 使用Floyd算法计算任意两个数据点之间的最短路径
dist_matrix = graph_shortest_path(knn_graph, directed=False)
# 基于最短路径计算数据点之间的测地距离
G = csgraph.laplacian(dist_matrix, normed=True)
eigvals, eigvecs = np.linalg.eig(G)
indices = np.argsort(eigvals)[:n_components]
Y = eigvecs[:, indices].real
return Y
```
LLE算法的实现:
LLE算法是一种基于局部线性嵌入的非线性降维方法,主要用于处理高维数据。其基本思想是在保持数据间的局部线性关系不变的情况下,将高维数据映射到低维空间中。
LLE算法的主要步骤如下:
1.对于每个数据点,找到与其距离最近的K个数据点,并使用它们构建一个K维线性空间。
2.计算每个数据点在该K维线性空间中的权重系数。
3.对于每个数据点,将其表示为其K个最近邻点的加权线性组合。
4.使用MDS算法将数据点映射到低维空间中。
下面是LLE算法的Python实现:
```python
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import cdist
from sklearn.utils.graph_shortest_path import graph_shortest_path
def lle(X, n_components, n_neighbors):
# 计算每个数据点之间的欧几里得距离
D = cdist(X, X)
# 对于每个数据点,找到与其距离最近的K个数据点,并使用它们构建一个K维线性空间
knn_indices = np.argsort(D, axis=1)[:, 1:n_neighbors+1]
knn_distances = np.array([D[i, knn_indices[i]] for i in range(X.shape[0])])
W = np.zeros((n_neighbors, n_neighbors))
for i in range(n_neighbors):
G = X[knn_indices[:, i]] - X
C = np.dot(G, G.T)
w = np.linalg.solve(C, np.ones(n_neighbors))
W[i] = w / np.sum(w)
M = np.eye(X.shape[0]) - np.dot(W, np.eye(n_neighbors))
# 计算每个数据点在该K维线性空间中的权重系数
eigvals, eigvecs = np.linalg.eig(np.dot(M.T, M))
indices = np.argsort(eigvals)[1:n_components+1]
Y = eigvecs[:, indices].real
# 对于每个数据点,将其表示为其K个最近邻点的加权线性组合
knn_indices = np.argsort(D, axis=1)[:, :n_neighbors]
knn_distances = np.array([D[i, knn_indices[i]] for i in range(X.shape[0])])
W = np.zeros((X.shape[0], n_neighbors))
for i in range(X.shape[0]):
G = X[knn_indices[i]] - X[i]
C = np.dot(G, G.T)
w = np.linalg.solve(C, np.ones(n_neighbors))
W[i] = w / np.sum(w)
Y = np.dot(W, Y)
# 使用MDS算法将数据点映射到低维空间中
G = cdist(Y, Y)
H = np.eye(X.shape[0]) - np.ones((X.shape[0], X.shape[0])) / X.shape[0]
S = -0.5 * np.dot(np.dot(H, G ** 2), H)
eigvals, eigvecs = np.linalg.eig(S)
indices = np.argsort(eigvals)[::-1][:n_components]
Y = eigvecs[:, indices].real
return Y
```
阅读全文