Windows 下载find_circ

时间: 2024-03-31 14:37:36 浏览: 11
你可以从 find_circ 的官方网站(http://circbase.org/download)下载适用于 Windows 操作系统的 find_circ。 1. 从网站下载 find_circ 的源代码,点击页面中的“Download”按钮,选择“find_circ.py”即可。 2. 下载完成后,解压缩下载的文件到你想要放置的目录中。 3. 打开命令提示符(CMD),进入到 find_circ 的解压缩目录中。 4. 在命令提示符中,输入以下命令来测试 find_circ 是否安装成功: ``` python find_circ.py -h ``` 如果 find_circ 安装成功,将输出 find_circ 的帮助信息。 注意:为了能够在 Windows 中运行 find_circ,你需要安装 Python 2.7,并将 Python 的路径添加到系统的环境变量中。此外,你还需要安装 Bowtie 1 和 Samtools,也需要将它们的路径添加到系统的环境变量中。
相关问题

find_circ 有Windows版本吗

是的,find_circ 有适用于 Windows 操作系统的版本。你可以从 find_circ 的官方网站(http://circbase.org/download)下载到 Windows 版本的 find_circ。 下载完成后,你需要解压缩下载的文件,并将解压后的文件夹添加到系统的环境变量中。 在 Windows 中,你可以使用以下命令来运行 find_circ: ``` find_circ.py -g <genome.fa> -p <prefix> -1 <read1.fq> -2 <read2.fq> [--quiet] ``` 其中,`<genome.fa>` 是参考基因组序列的 fasta 格式文件,`<prefix>` 是输出文件的前缀,`<read1.fq>` 和 `<read2.fq>` 分别是 RNA-seq 测序数据的第一条和第二条 reads。 如果你想要了解更多关于如何使用 find_circ,可以参考 find_circ 的官方文档。

Ubuntu 安装find_circ

要在Ubuntu系统上安装find_circ,您可以按照以下步骤进行操作: 1. 打开终端,并使用以下命令下载find_circ的安装包: ``` wget https://github.com/marvin-jens/find_circ/releases/download/v1.2.1/find_circ-1.2.1.tar.gz ``` 2. 下载完成后,使用以下命令解压缩安装包: ``` tar -zxvf find_circ-1.2.1.tar.gz ``` 3. 进入解压缩后的find_circ文件夹,并使用以下命令编译和安装find_circ: ``` cd find_circ-1.2.1 make sudo make install ``` 4. 上述步骤完成后,您可以使用以下命令来检查find_circ是否已经成功安装: ``` find_circ -h ``` 如果该命令能够正常执行并输出帮助信息,则说明find_circ已经成功安装。

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